战舰联盟的战斗玩法中分为人机挑战、人机对战、玩家对战，以下将会详细介绍。

人机挑战

人机挑战分三种模式：初级、中级、高级，各个模式的地图规模不同、难度也不同

挑战从0层开始，每次挑战成功一次，胜利层数增加1，挑战失败胜利层则减少1

每个模式的每一层首胜都可以获得额外的金币奖励，层数越高，友军则越少，奖励也相对越多，每周会重置挑战层数和首胜奖励

人机对战

人机对战为玩家对电脑AI的对战，人数至少是4V4，每次匹配的电脑AI船舰等级与玩家船舰的等级接近

当匹配不到最少3名玩家队友时，会自动补充电脑作为队友与AI战斗

玩家对玩家

玩家对战为玩家之间的PVP对战，进入后皆为随机匹配与自己战舰等级相近的其他玩家

匹配最大数为12V12，最小数对战为1V1，地图随机，战斗收益是人机对战收益的3倍